Особо охраняемые лесные территории образуют природно-заповедный фонд Кыргызской Республики, который находится под особой охраной государства. Сюда включают леса разных категорий защищенности: государственные заповедники, государственные природные национальные парки, комплексные заказники, лесные заказники. На территории лесов расположены охотничьи и государственные заказники.

На сегодняшний день в Кыргызстане имеются 83 особо охраняемые природные территории (ООПТ) общей площадью 761.30тыс. га, что составляет 3.9% всей территории республики.

Существующая в стране сеть особо охраняемых территорий (ООПТ) включает в себя два национальных и четыре природных парка, шесть заповедников, 83 заказника, одну биосферную территорию – «Ыссык-Кёль».